脉冲网帮助华盛顿公共卫生解决近期历史上最大的沙门氏菌爆发

脉冲网帮助华盛顿公共卫生解决近期历史上最大的沙门氏菌爆发

金·克里斯伯格(Kim Krisberg)

在华盛顿州,一小群 食源性疾病 在给定年份内弹出。但是在2015年中期, 沙门氏菌 多个县之间的集群开始一个接一个地弹出,公共卫生工作者知道他们手上的问题更大。

最终,借助称为“ 脉冲网,州和地方公共卫生研究人员能够将近两打 沙门氏菌 聚类并追踪来源,归因于华盛顿的污染猪肉 Kapowsin肉,最终召回了超过116,000磅的全猪和523,000磅的猪肉产品。但是解决这一暴发有很多曲折,公共卫生工作者首先怀疑是罪魁祸首-牛肉。

“起初,我们不确定是什么使人生病,”该病分子流行病学家AilynPérez-Osorio博士说 华盛顿州卫生部公共卫生实验室。 “第一批集群中的一个来自埃塞俄比亚的毕业典礼,他们通常不吃猪肉,所以这很令人困惑。”

沙门氏菌 集群于2015年6月开始出现,规模最大的集群是八人一组,他们参加了埃塞俄比亚的毕业典礼。一年前,埃塞俄比亚社区的聚会和饭店也发生了类似事件, 沙门氏菌 华盛顿州卫生部的食源性和肠道疾病流行病学家贝丝·梅利乌斯(Beth Melius)称,这些食物簇可追溯到传统的埃塞俄比亚菜中称为基特夫的生牛肉。因此,当八人组在2015年夏季弹出时,其血清型与上一年的相同 沙门氏菌 应变, 沙门氏菌 我4,[5],12:i:-,公共卫生调查人员自然而然地将生牛肉作为潜在来源。

但是随后事件发生了变化。在埃塞俄比亚政党聚集的几天和几周内,州和地方公共卫生部门开始收到有关 沙门氏菌 与烤猪和活猪接触有关的疾病。在从病人身上分离出病菌后,公共卫生实验室的工作人员开始使用脉冲场凝胶电泳或 通用电气,以确定样品的DNA指纹。 通用电气结果一遍又一遍地发现了相同的模式。但是公共卫生调查人员仍然感到困惑-PFGE模式在华盛顿尤为罕见,因此所有疾病都与相同的污染源相关是有道理的。但是,埃塞俄比亚庆祝活动中的生牛肉和烤猪中的猪肉有何关系?

公共卫生和 环境卫生 调查人员着陆了,采访了购买与猪相连的全部猪的居民。 沙门氏菌 聚集,收集尽可能多的剩余食物进行测试,并到达生病居民购物或进食的市场和餐馆。最终,华盛顿州卫生与公共卫生部的公共卫生工作者—西雅图&金郡(King County)将受污染猪肉的可能来源追溯到Kapowsin Meats。梅利厄斯说,整个调查不到两个月。对于尚未报告吃猪肉的生病居民,公共卫生检查员认为交叉污染是罪魁祸首。佩雷斯·奥索里奥(Pérez-Osorio)说,例如,在埃塞俄比亚一家生病的居民就餐的餐馆里,检查人员在也用于牛肉的绞肉机中发现了残留的污染猪肉。

总而言之,根据 疾病预防与控制中心192人感染了 沙门氏菌 I 4,[5],12:i:-(188)和 沙门氏菌 五个州的Infantis(4):华盛顿州184人,阿拉斯加1人,加利福尼亚州2人,爱达荷州2人,俄勒冈州3人。此外,CDC的 国家抗菌素耐药性监测系统 实验室对爆发期间患病的10名患者的分离株进行了抗药性测试,发现所有10个样品均具有多药耐药性。

在可获得信息的180名患者中,有17%必须住院。爆发期间没有死亡报告,梅利乌斯说这是该州最大的 沙门氏菌 最近爆​​发的历史。

佩雷斯·奥索里奥和梅利乌斯都说 脉冲网于2016年庆祝成立20周年,对于解决疫情至关重要。

Pérez-Osorio说:“ 脉冲网不仅使您可以按模式查看数据,而且还可以根据案例的来源查看数据-它可以帮助您将所有数据绘制出来。” “不仅仅是国家之间的联系;整个PulseNet系统使我们的实验室能够访问使我们能够快速解决这些爆发调查的方法。”

梅利厄斯说,PulseNet允许公共卫生工作者比其他人更快地“破解”多县爆发。她说,在华盛顿的十二个县中发生了这么多小规模的疫情,她说,PulseNet是帮助调查人员确定哪些集群和个别疾病与更大的疫情有关的关键。

Melius说:“我认为,如果没有PulseNet,我们将无法解决一半的暴发流行。”他还指出,该州的公共卫生实验室在短短几个月内就对100多个样本进行了PFGE测试,每个隔离区需要16个小时的动手工作。 “这是流行病学,实验室工作和PulseNet的结合,这就是我们解决爆发的方式,如果没有所有这些方面,我们将无法做到。”

附带说明的是,佩雷斯·奥索里奥(Pérez-Osorio)提到,随着临床实验室中与文化无关的诊断测试的出现,解决此类研究将来可能会面临其他挑战。她解释说,这样的测试使临床实验室能够确定使人生病的细菌的一般类型,而无需在实验室中生长或培养细菌。这意味着临床实验室可以更快,更低成本地确定一个人的病因。另一方面,该方法并没有生成公共卫生实验室连接看似独立的疾病并检测出更大爆发所需的特殊分离株。

Pérez-Osorio说:“问题是,产生隔离株非常昂贵,作为一个公共卫生实验室,我们没有做到这一点-我们已经开始分析该隔离株。” “目前,所有公共卫生实验室都在某种程度上面对这一问题。”

根据 CDC,PulseNet每年可识别约1,500个食源性疾病群,约250个跨州界的食源性疾病,以及约30个多源性暴发源于食物来源。最近 经济评价 脉冲网的研究发现,实验室网络每年可预防266,500多种疾病 沙门氏菌,有近9,500种疾病 大肠杆菌 和56来自 李斯特菌。这意味着减少了5.07亿美元的医疗和生产力成本。

 

(照片来源: 美国农业部)

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